深式进水口的拦污栅高度与水库水位和清污方式有关。对于不需要经常清污的，其顶部高程可略高于防洪限制水位（见水库特征值）；需要经常清污的，则应高于需要清污的水位。高度较大的拦污栅，可做成几节，每节的尺寸可根据起吊能力确定。
严重时压力超过栅体材料弯曲应力限值，导致栅体结构变形甚至压垮，失去对泵站的保护作用。
运行扬程增加，功率，时间延长。

浮筒(箱)也容易翻转，增加设计难度的同时也增加了工程投资，使得拦污排不经济；反之，吃水深度过小，工程投资和设计难度降低了，但拦污效果较差。

多数泵站闸口都有钢制拦污栅对垃圾进行阻拦隔离，但是汛期雨水季节垃圾较多，特别是水流量较大区域，会对拦污栅形成堵塞，影响取水口的正常运转。

污物清理可用人工或清污机。人工清污适用深度较浅，一般不超过5m。当拦污栅位于水下较深时，多用清污机清污;必要时也可设置两道拦污栅，需要清污时,先将备用拦污栅放入检修门槽内，而后将工作拦污栅吊出进行清理。
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